胃肠道传染病是严重威胁人民群众身体健康和生命安全的重要公共卫生问题‌。近年来，随着经济社会的快速发展，人口流动日益频繁，气候变化复杂多样，胃肠道传染病的防控形势也越来越严峻。胃肠道传染病是一组经消化道传播的疾病。常见的主要有伤寒、副伤寒、细菌性痢疾、霍乱、甲型肝炎、细菌性食物中毒等。胃肠道传染病病人的病原体从病人和病原携带者的粪便、呕吐物中排出，污染了周围环境，再通过水、食物、手、苍蝇、蟑螂、等媒介经口腔进入胃肠道，在人体内繁殖、产生毒素引起发病，并继续排出病原体再传染给其他健康人。 

胃肠道传染病大多分为三类：细菌性痢疾、霍乱、其他感染性腹泻。其中其他感染性腹泻是一组多病原多因素引起的疾病，指除霍乱、痢疾、伤寒、副伤寒以外的感染性腹泻，是《中华人民共和国传染病防治法》中规定的丙类传染病，是我国的常见病和多发病。其他感染性病原体主要包括细菌、病毒、原虫等，根据病原学分类分为：细菌性腹泻、病毒性腹泻、寄生虫性腹泻。其中绝大多数病毒性腹泻系由轮状病毒引起。感染性腹泻临床表现可有腹痛、腹泻，并可有发热、恶心、呕吐等症状。因此，精准明确致病因子是具有重大意义的。

从临床诊疗角度看，1.提高疗效，减少患者痛苦；

                  2.避免滥用抗生素，遏制耐药性；

                  3.鉴别重症风险，优化治疗方案。

从公共卫生防控角度看，1.追溯传染源，切断传播途径；

                      2.进行有效监测和预警；

                      3.实现资源最优配置。